ประมงทะเลและโรงงานแปรรูปอาหารทะเล: ใบอนุญาตและห้องเย็น
กิจการประมงพาณิชย์ในปัตตานีต้องขอใบอนุญาตทำการประมงพาณิชย์ตามพระราชกำหนดการประมง ซึ่งกำหนดโควตาและเขตทำการประมงตามขนาดเรือและเครื่องมือประมงอย่างเข้มงวด เจ้าของเรือที่ต้องการต่อใบอนุญาตประจำปีต้องติดตั้งระบบติดตามเรือ (VMS) และปฏิบัติตามเงื่อนไขการแจ้งเข้าออกท่าเทียบเรือที่ศูนย์ควบคุมการแจ้งเรือเข้าออก (PIPO) อย่างครบถ้วน การละเลยเงื่อนไขเหล่านี้อาจทำให้ถูกเพิกถอนใบอนุญาตและถูกดำเนินคดีตามกฎหมายประมงผิดกฎหมาย
โรงงานแปรรูปอาหารทะเลและห้องเย็นในปัตตานีที่รับซื้อวัตถุดิบจากเรือประมงต้องจัดทำระบบตรวจสอบย้อนกลับ (traceability) ตามที่กรมประมงกำหนด เพื่อให้สามารถยืนยันแหล่งที่มาของสัตว์น้ำได้ตลอดห่วงโซ่การผลิต ซึ่งเป็นเงื่อนไขสำคัญสำหรับการส่งออกไปยังตลาดสหภาพยุโรปและสหรัฐอเมริกาที่มีมาตรการตรวจสอบการประมงผิดกฎหมาย ขาดการรายงาน และไร้การควบคุม (IUU) อย่างเข้มงวด
โรงงานแปรรูปที่จดทะเบียนเป็นนิติบุคคลยังต้องขออนุญาตประกอบกิจการโรงงานตามประเภทและกำลังการผลิตจากสำนักงานอุตสาหกรรมจังหวัดปัตตานี รวมถึงต้องปฏิบัติตามกฎหมายสิ่งแวดล้อมเรื่องการบำบัดน้ำเสียก่อนปล่อยลงสู่แหล่งน้ำสาธารณะ เนื่องจากกระบวนการแปรรูปอาหารทะเลก่อให้เกิดน้ำเสียปริมาณมากและมีกลิ่นที่อาจกระทบชุมชนโดยรอบ
